Magaña y Arroyo, Juan de  Uno de los principales conquistadores de Yucatán en la última etapa de esta guerra. Por más de 17 años se desempeñó como teniente general. De su propio peculio mantuvo armas, caballos y criados para la defensa y pacificación de estas provincias, con motivo de las frecuentes rebeliones. Estuvo presente en todas las acciones de guerra de la última fase de la Conquista y desempeñó sin sueldo el cargo de tesorero de la Real Hacienda.

Robert Chamberlain, en su libro Conquista y colonización de Yucatán, lo menciona como encomendero de Sotuta y Tibolón, avecindado en Mérida, que escribió el 1 de enero de 1581, una Relación, correspondiente a dichos pueblos. Juan de Magaña aparece en una nómina parcial de los principales vecinos de Mérida, donde se anota que «vino a Yucatán con Leonor de Aldana, natural de la Ciudad de México, y con sus suegros, Juan de Sosa y Leonor de Aldana».